Рак падстраўнікавай залозы - адна з самых смяротных пухлін у свеце з дрэнным прагнозам.Такім чынам, неабходная дакладная мадэль прагназавання для выяўлення пацыентаў з высокай рызыкай рака падстраўнікавай залозы, каб адаптаваць лячэнне і палепшыць прагноз для гэтых пацыентаў.
Мы атрымалі дадзеныя RNAseq адэнакарцыномы падстраўнікавай залозы (PAAD) Атласа геному рака (TCGA) з базы дадзеных UCSC Xena, вызначылі звязаныя з імуннай сістэмай lncRNA (irlncRNA) з дапамогай карэляцыйнага аналізу і выявілі адрозненні паміж TCGA і нармальнымі тканінамі аденокарциномы падстраўнікавай залозы.DEirlncRNA) з TCGA і тканкавай экспрэсіі генатыпу (GTEx) тканіны падстраўнікавай залозы.Для пабудовы прагнастычных мадэляў подпісаў былі праведзены дадатковыя аднамерныя і ласо-рэгрэсійныя аналізы.Затым мы разлічылі плошчу пад крывой і вызначылі аптымальнае лімітавае значэнне для ідэнтыфікацыі пацыентаў з аденокарциномой падстраўнікавай залозы высокага і нізкага рызыкі.Каб параўнаць клінічныя характарыстыкі, інфільтрацыю імунных клетак, імунасупрэсіўную мікраасяроддзе і ўстойлівасць да хіміятэрапіі ў пацыентаў з высокім і нізкім рызыкай рака падстраўнікавай залозы.
Мы вызначылі 20 пар DEirlncRNA і згрупавалі пацыентаў у адпаведнасці з аптымальным парогавым значэннем.Мы прадэманстравалі, што наша прагнастычная сігнатурная мадэль мае значную эфектыўнасць у прагназаванні прагнозу пацыентаў з PAAD.AUC крывой ROC складае 0,905 для прагнозу на 1 год, 0,942 для прагнозу на 2 гады і 0,966 для прагнозу на 3 гады.Пацыенты з высокай рызыкай мелі больш нізкі ўзровень выжывальнасці і горшыя клінічныя характарыстыкі.Мы таксама паказалі, што ў пацыентаў з высокай рызыкай імунная супрэсія і ў іх можа развіцца ўстойлівасць да імунатэрапіі.Ацэнка супрацьпухлінных прэпаратаў, такіх як паклітаксел, сарафеніб і эрлотиниб, заснаваная на вылічальных інструментах прагназавання, можа быць мэтазгоднай для пацыентаў высокай рызыкі з PAAD.
У цэлым наша даследаванне стварыла новую мадэль прагнастычнай рызыкі, заснаваную на парнай irlncRNA, якая паказала шматспадзеўную прагнастычную каштоўнасць у пацыентаў з ракам падстраўнікавай залозы.Наша прагнастычная мадэль рызыкі можа дапамагчы адрозніць пацыентаў з PAAD, якія падыходзяць для медыкаментознага лячэння.
Рак падстраўнікавай залозы - злаякасная пухліна з нізкай пяцігадовай выжывальнасцю і высокім узроўнем.На момант пастаноўкі дыягназу большасць пацыентаў ужо знаходзяцца на запушчаных стадыях.У кантэксце эпідэміі COVID-19 лекары і медсёстры знаходзяцца пад велізарным ціскам пры лячэнні пацыентаў з ракам падстраўнікавай залозы, а сем'і пацыентаў таксама сутыкаюцца з рознымі ціскамі пры прыняцці рашэнняў аб лячэнні [1, 2].Нягледзячы на тое, што ў лячэнні DOAD былі дасягнуты вялікія поспехі, такія як неоадъювантная тэрапія, хірургічная рэзекцыя, прамянёвая тэрапія, хіміятэрапія, таргетную малекулярная тэрапія і інгібітары імунных кантрольных кропак (ICI), толькі каля 9% пацыентаў выжываюць праз пяць гадоў пасля пастаноўкі дыягназу [3]. ].], 4].Паколькі раннія сімптомы аденокарциномы падстраўнікавай залозы нетыповыя, метастазы ў пацыентаў звычайна дыягнастуюць на запушчанай стадыі [5].Такім чынам, для дадзенага пацыента індывідуальнае комплекснае лячэнне павінна ўзважыць перавагі і недахопы ўсіх варыянтаў лячэння не толькі для падаўжэння выжывальнасці, але і для паляпшэння якасці жыцця [6].Такім чынам, эфектыўная мадэль прагназавання неабходная для дакладнай ацэнкі прагнозу пацыента [7].Такім чынам, можна выбраць адпаведнае лячэнне, каб збалансаваць выжывальнасць і якасць жыцця пацыентаў з PAAD.
Дрэнны прагноз PAAD у асноўным звязаны з устойлівасцю да хіміятэрапеўтычных прэпаратаў.У апошнія гады інгібітары імунных кантрольных кропак шырока выкарыстоўваюцца ў лячэнні салідных пухлін [8].Аднак выкарыстанне ICI пры раку падстраўнікавай залозы рэдка бывае паспяховым [9].Такім чынам, важна вызначыць пацыентаў, якія могуць атрымаць карысць ад тэрапіі ICI.
Доўгая некадзіруючая РНК (lncRNA) - гэта тып некадзіруючай РНК з транскрыптамі >200 нуклеатыдаў.LncRNA шырока распаўсюджаныя і складаюць каля 80% транскрыптому чалавека [10].Вялікая колькасць работ паказала, што прагнастычныя мадэлі на аснове lncRNA могуць эфектыўна прадказваць прагноз пацыента [11, 12].Напрыклад, 18 звязаных з аўтафагіяй lncRNAs былі ідэнтыфікаваны для стварэння прагнастычных прыкмет пры раку малочнай залозы [13].Шэсць іншых звязаных з імуннай сістэмай lncRNAs былі выкарыстаны для ўстанаўлення прагнастычных асаблівасцяў глиомы [14].
Пры раку падстраўнікавай залозы некаторыя даследаванні ўсталявалі сігнатуры на аснове lncRNA для прагназавання прагнозу пацыента.Сігнатура 3-lncRNA была ўстаноўлена ў аденокарциноме падстраўнікавай залозы з плошчай пад крывой ROC (AUC) толькі 0,742 і агульнай выжывальнасцю (OS) 3 гады [15].Акрамя таго, значэнні экспрэсіі lncRNA адрозніваюцца ў розных геномаў, розных фарматаў даных і розных пацыентаў, і прадукцыйнасць прагнастычнай мадэлі нестабільная.Такім чынам, мы выкарыстоўваем новы алгарытм мадэлявання, спарванне і ітэрацыю, каб генераваць звязаныя з імунітэтам lncRNA (irlncRNA) подпісы для стварэння больш дакладнай і стабільнай прагнастычнай мадэлі [8].
Нармалізаваныя дадзеныя RNAseq (FPKM) і клінічныя дадзеныя TCGA рака падстраўнікавай залозы і экспрэсіі генатыпу тканіны (GTEx) былі атрыманы з базы дадзеных UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/).Файлы GTF былі атрыманы з базы дадзеных Ensembl (http://asia.ensembl.org) і выкарыстоўваліся для здабывання профіляў экспрэсіі lncRNA з RNAseq.Мы спампавалі гены, звязаныя з імунітэтам, з базы дадзеных ImmPort (http://www.immport.org) і вызначылі звязаныя з імунітэтам lncRNA (irlncRNA) з дапамогай карэляцыйнага аналізу (p <0,001, r> 0,4).Ідэнтыфікацыя irlncRNA з дыферэнцыяльнай экспрэсіяй (DEirlncRNA) шляхам скрыжавання irlncRNA і lncRNA з дыферэнцыяльнай экспрэсіяй, атрыманых з базы дадзеных GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) у кагорце TCGA-PAAD (|logFC| > 1 і FDR ) <0,05).
Пра гэты метад паведамлялася раней [8].У прыватнасці, мы ствараем X, каб замяніць парныя lncRNA A і lncRNA B. Калі значэнне экспрэсіі lncRNA A вышэй, чым значэнне экспрэсіі lncRNA B, X вызначаецца як 1, у адваротным выпадку X вызначаецца як 0. Такім чынам, мы можам атрымаць матрыца 0 або – 1. Вертыкальная вось матрыцы ўяўляе кожны ўзор, а гарызантальная вось уяўляе кожную пару DEirlncRNA са значэннем 0 або 1.
Аднамерны рэгрэсійны аналіз з наступнай рэгрэсіяй Ласо быў выкарыстаны для скрынінга прагнастычных пар DEirlncRNA.У рэгрэсійным аналізе ласо выкарыстоўвалася 10-кратная перакрыжаваная праверка, якая паўтаралася 1000 разоў (p <0,05), з 1000 выпадковымі раздражняльнікамі за прагон.Калі частата кожнай пары DEirlncRNA перавышала 100 разоў за 1000 цыклаў, пары DEirlncRNA адбіраліся для пабудовы прагнастычнай мадэлі рызыкі.Затым мы выкарыстоўвалі крывую AUC, каб знайсці аптымальнае лімітавае значэнне для класіфікацыі пацыентаў з PAAD на групы высокай і нізкай рызыкі.Значэнне AUC кожнай мадэлі таксама было разлічана і нанесена ў выглядзе крывой.Калі крывая дасягае самай высокай кропкі, якая паказвае максімальнае значэнне AUC, працэс разліку спыняецца, і мадэль лічыцца лепшым кандыдатам.Былі пабудаваны мадэлі 1-, 3- і 5-гадовай крывой ROC.Аднамерны і шматмерны Рэгрэсійная аналізы выкарыстоўваліся для вывучэння незалежнай прагнастычнай эфектыўнасці мадэлі прагнастычнага рызыкі.
Выкарыстоўвайце сем інструментаў для вывучэння хуткасці інфільтрацыі імунных клетак, у тым ліку XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS і CIBERSORT.Дадзеныя аб інфільтрацыі імунных клетак былі загружаны з базы дадзеных TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3).Розніца ў змесце імунных інфільтрацыйных клетак паміж групамі высокага і нізкага рызыкі пабудаванай мадэлі была прааналізавана з дапамогай знакава-рангавага крытэра Уілкаксана, вынікі паказаны на квадратным графіку.Карэляцыйны аналіз Спірмена быў праведзены для аналізу ўзаемасувязі паміж значэннямі балаў рызыкі і клеткамі, якія інфільтравалі імунную сістэму.Атрыманы каэфіцыент карэляцыі паказаны ў выглядзе лядзяша.Парог значнасці быў усталяваны на р <0,05.Працэдура выконвалася з дапамогай пакета R ggplot2.Каб вывучыць ўзаемасувязь паміж мадэллю і ўзроўнямі экспрэсіі генаў, звязаных з хуткасцю інфільтрацыі імунных клетак, мы правялі візуалізацыю пакета ggstatsplot і скрыпкі.
Для ацэнкі клінічных мадэляў лячэння рака падстраўнікавай залозы мы разлічылі IC50 звычайна выкарыстоўваюцца хіміятэрапеўтычных прэпаратаў у кагорце TCGA-PAAD.Адрозненні ў палавінных інгібіруючых канцэнтрацыях (IC50) паміж групамі высокай і нізкай рызыкі параўноўвалі з дапамогай знакава-рангавага тэсту Уілкаксана, і вынікі паказаны ў выглядзе скрынкавых графікаў, створаных з дапамогай pRRophetic і ggplot2 у R. Усе метады адпавядаюць адпаведным рэкамендацыям і нормам.
Рабочы працэс нашага даследавання паказаны на малюнку 1. Выкарыстоўваючы карэляцыйны аналіз паміж lncRNA і генамі, звязанымі з імунітэтам, мы выбралі 724 irlncRNA з p <0,01 і r> 0,4.Далей мы прааналізавалі дыферэнцыяльна экспрэсіраваныя lncRNAs GEPIA2 (малюнак 2A).У агульнай складанасці 223 irlncRNAs былі дыферэнцыяльна экспрэсаваныя паміж аденокарциномой падстраўнікавай залозы і нармальнай тканінай падстраўнікавай залозы (|logFC| > 1, FDR <0,05), названыя DEirlncRNAs.
Пабудова прагнозных мадэляў рызыкі.(A) Вулкан ўчастак дыферэнцыравана экспрессируемых lncRNAs.(B) Размеркаванне каэфіцыентаў ласо для 20 пар DEirlncRNA.(C) Частковая дысперсія верагоднасці размеркавання каэфіцыента LASSO.(D) лясны ўчастак, які паказвае аднамерны рэгрэсійны аналіз 20 пар DEirlncRNA.
Затым мы пабудавалі матрыцу 0 або 1 шляхам спалучэння 223 DEirlncRNA.Усяго было ідэнтыфікавана 13 687 пар DEirlncRNA.Пасля аднамернага і ласо рэгрэсійнага аналізу 20 пар DEirlncRNA былі нарэшце пратэставаны для пабудовы прагнастычнай мадэлі рызыкі (малюнак 2B-D).На падставе вынікаў Ласо і множнага Рэгрэсійная аналізу мы разлічылі ацэнку рызыкі для кожнага пацыента ў кагорце TCGA-PAAD (табл. 1).На падставе вынікаў рэгрэсійнага аналізу па ласо мы разлічылі ацэнку рызыкі для кожнага пацыента ў кагорце TCGA-PAAD.AUC крывой ROC склала 0,905 для прагнозу мадэлі рызыкі на 1 год, 0,942 для прагнозу на 2 гады і 0,966 для прагнозу на 3 гады (малюнак 3A-B).Мы ўстанавілі аптымальнае лімітавае значэнне 3,105, стратыфікавалі пацыентаў кагорты TCGA-PAAD на групы высокай і нізкай рызыкі і пабудавалі вынікі выжывання і размеркаванне балаў рызыкі для кожнага пацыента (малюнак 3C-E).Аналіз Каплана-Майера паказаў, што выжывальнасць пацыентаў з PAAD у групе высокай рызыкі была значна ніжэй, чым у пацыентаў з групы нізкай рызыкі (p <0,001) (малюнак 3F).
Валіднасць прагнастычных мадэляў рызыкі.(A) ROC мадэлі прагнастычнага рызыкі.(B) 1-, 2- і 3-гадовы ROC прагнастычныя мадэлі рызыкі.(C) ROC мадэлі прагнастычнага рызыкі.Паказвае аптымальную кропку адсячэння.(DE) Размеркаванне статусу выжывання (D) і балы рызыкі (E).(F) Аналіз Каплана-Майера пацыентаў з PAAD у групах высокай і нізкай рызыкі.
Далей мы ацанілі адрозненні ў балах рызыкі па клінічных характарыстыках.Палоскавы графік (малюнак 4A) паказвае агульную залежнасць паміж клінічнымі характарыстыкамі і баламі рызыкі.У прыватнасці, пажылыя пацыенты мелі больш высокія паказчыкі рызыкі (малюнак 4B).Акрамя таго, пацыенты са стадыяй II мелі больш высокія паказчыкі рызыкі, чым пацыенты са стадыяй I (малюнак 4C).Што тычыцца ступені пухліны ў пацыентаў з PAAD, пацыенты 3 ступені мелі больш высокія паказчыкі рызыкі, чым пацыенты 1 і 2 ступені (малюнак 4D).Далей мы правялі аднамерны і шматмерны Рэгрэсійная аналізы і прадэманстравалі, што паказчык рызыкі (p <0,001) і ўзрост (p = 0,045) былі незалежнымі прагнастычнымі фактарамі ў пацыентаў з PAAD (малюнак 5A-B).Крывая ROC прадэманстравала, што ацэнка рызыкі пераўзыходзіць іншыя клінічныя характарыстыкі ў прагназаванні 1-, 2- і 3-гадовай выжывальнасці пацыентаў з PAAD (малюнак 5C-E).
Клінічная характарыстыка мадэляў прагнастычнай рызыкі.Гістаграма (A) паказвае (B) узрост, (C) стадыю пухліны, (D) ступень пухліны, ацэнку рызыкі і пол пацыентаў у кагорце TCGA-PAAD.**р <0,01
Незалежны прагнастычны аналіз мадэляў прагнастычных рызык.(AB) Аднамерны (A) і шматмерны (B) Рэгрэсійная аналіз мадэляў прагнастычнага рызыкі і клінічных характарыстык.(CE) 1-, 2- і 3-гадовы ROC для прагнастычных мадэляў рызыкі і клінічных характарыстык
Такім чынам, мы вывучылі ўзаемасувязь паміж баламі часу і рызыкі.Мы выявілі, што паказчык рызыкі ў пацыентаў з PAAD быў у зваротнай карэляцыі з CD8+ Т-клеткамі і NK-клеткамі (малюнак 6A), што паказвае на прыгнечаную імунную функцыю ў групе высокай рызыкі.Мы таксама ацанілі розніцу ў інфільтрацыі імунных клетак паміж групамі высокай і нізкай рызыкі і знайшлі аднолькавыя вынікі (малюнак 7).У групе высокай рызыкі інфільтрацыя CD8+ Т-клетак і NK-клетак была меншай.У апошнія гады інгібітары імунных кантрольных кропак (ICI) шырока выкарыстоўваюцца ў лячэнні салідных пухлін.Аднак выкарыстанне ICI пры раку падстраўнікавай залозы рэдка бывае паспяховым.Такім чынам, мы ацанілі экспрэсію генаў імунных кантрольных кропак у групах высокай і нізкай рызыкі.Мы выявілі, што CTLA-4 і CD161 (KLRB1) былі празмерна выяўленыя ў групе нізкага рызыкі (малюнак 6B-G), што паказвае на тое, што пацыенты з PAAD у групе нізкага рызыкі могуць быць адчувальныя да ICI.
Карэляцыйныя аналіз мадэлі прагнастычнага рызыкі і інфільтрацыі імунных клетак.(A) Карэляцыя паміж прагнастычнай мадэллю рызыкі і інфільтрацыі імунных клетак.(BG) Паказвае экспрэсію генаў у групах высокай і нізкай рызыкі.(HK) Значэнні IC50 для пэўных супрацьракавых прэпаратаў у групах высокай і нізкай рызыкі.*p <0,05, **p <0,01, ns = незначна
Далей мы ацанілі сувязь паміж баламі рызыкі і звычайнымі хіміятэрапеўтычнымі сродкамі ў кагорце TCGA-PAAD.Мы шукалі супрацьпухлінныя прэпараты, якія часта выкарыстоўваюцца пры раку падстраўнікавай залозы, і прааналізавалі адрозненні іх значэнняў IC50 паміж групамі высокай і нізкай рызыкі.Вынікі паказалі, што значэнне IC50 AZD.2281 (олапарыб) было вышэй у групе высокай рызыкі, што паказвае на тое, што пацыенты з PAAD у групе высокай рызыкі могуць быць устойлівымі да лячэння AZD.2281 (малюнак 6H).Акрамя таго, значэнні IC50 для паклітаксела, сарафеніба і эрлотиниба былі ніжэй у групе высокай рызыкі (малюнак 6I-K).Далей мы вызначылі 34 супрацьпухлінныя прэпараты з больш высокімі значэннямі IC50 у групе высокай рызыкі і 34 супрацьпухлінныя прэпараты з больш нізкімі значэннямі IC50 у групе высокай рызыкі (табліца 2).
Нельга адмаўляць, што lncRNA, mRNA і miRNA шырока існуюць і гуляюць вырашальную ролю ў развіцці рака.Існуе дастаткова доказаў, якія пацвярджаюць важную ролю мРНК або микроРНК у прагназаванні агульнай выжывальнасці пры некалькіх тыпах раку.Несумненна, многія прагнастычныя мадэлі рызыкі таксама заснаваныя на lncRNA.Напрыклад, Luo et al.Даследаванні паказалі, што LINC01094 гуляе ключавую ролю ў праліферацыі і метастазірованія ПК, а высокая экспрэсія LINC01094 паказвае на дрэнную выжывальнасць пацыентаў з ракам падстраўнікавай залозы [16].Даследаванне, прадстаўленае Lin et al.Даследаванні паказалі, што зніжэнне рэгуляцыі lncRNA FLVCR1-AS1 звязана з дрэнным прагнозам у пацыентаў з ракам падстраўнікавай залозы [17].Аднак lncRNA, звязаныя з імунітэтам, адносна менш абмяркоўваюцца з пункту гледжання прагназавання агульнай выжывальнасці хворых на рак.У апошні час вялікая колькасць работ было накіравана на пабудову прагнастычных мадэляў рызыкі для прагназавання выжывальнасці анкалагічных хворых і тым самым карэкціроўкі метадаў лячэння [18, 19, 20].Расце прызнанне важнай ролі імунных інфільтратаў у ініцыяцыі рака, прагрэсаванні і рэакцыі на такія метады лячэння, як хіміятэрапія.Шматлікія даследаванні пацвердзілі, што імунныя клеткі, инфильтрирующие пухліны, гуляюць важную ролю ў адказе на цітотоксіческой хіміятэрапію [21, 22, 23].Імунная мікраасяроддзе пухліны з'яўляецца важным фактарам выжывальнасці пацыентаў з пухлінамі [24, 25].Імунатэрапія, асабліва ICI тэрапія, шырока выкарыстоўваецца ў лячэнні салідных пухлін [26].Гены, звязаныя з імуннай сістэмай, шырока выкарыстоўваюцца для пабудовы прагнастычных мадэляў рызыкі.Напрыклад, Су і інш.Мадэль прагнастычнага рызыкі, звязаная з імуннай сістэмай, заснавана на генах, якія кадуюць вавёркі, каб прагназаваць прагноз пацыентаў з ракам яечнікаў [27].Некадуючыя гены, такія як lncRNA, таксама падыходзяць для пабудовы прагнастычных мадэляў рызыкі [28, 29, 30].Luo і інш пратэставалі чатыры звязаныя з імуннай сістэмай lncRNAs і пабудавалі мадэль прагназавання рызыкі рака шыйкі маткі [31].Хан і інш.Усяго было ідэнтыфікавана 32 дыферэнцыравана экспрэсаваных транскрыптаў, і на аснове гэтага была створана мадэль прагназавання з 5 значнымі транскрыптамі, якая была прапанавана ў якасці настойліва рэкамендаванага інструмента для прагназавання вострага адрыньвання пасля трансплантацыі ныркі, пацверджанага біяпсіяй [32].
Большасць гэтых мадэляў заснавана на ўзроўнях экспрэсіі генаў, альбо генаў, якія кадуюць бялок, альбо генаў, якія не кадуюць.Аднак адзін і той жа ген можа мець розныя значэнні экспрэсіі ў розных геномах, фарматах даных і ў розных пацыентаў, што прыводзіць да нестабільных ацэнак у прагнастычных мадэлях.У гэтым даследаванні мы пабудавалі разумную мадэль з дзвюма парамі lncRNA, незалежна ад дакладных значэнняў экспрэсіі.
У гэтым даследаванні мы ўпершыню вызначылі irlncRNA з дапамогай карэляцыйнага аналізу з генамі, звязанымі з імунітэтам.Мы адкрылі 223 DEirlncRNAs шляхам гібрыдызацыі з дыферэнцыяльна экспрэсіраванымі lncRNAs.Па-другое, мы пабудавалі матрыцу 0-ці-1 на аснове апублікаванага метаду спарвання DEirlncRNA [31].Затым мы правялі аднамерны і рэгрэсійны аналіз ласо, каб вызначыць прагнастычныя пары DEirlncRNA і пабудаваць прагнастычную мадэль рызыкі.Далей мы прааналізавалі сувязь паміж баламі рызыкі і клінічнымі характарыстыкамі ў пацыентаў з PAAD.Мы выявілі, што наша прагнастычная мадэль рызыкі, як незалежны прагнастычны фактар у пацыентаў з PAAD, можа эфектыўна адрозніваць пацыентаў з высокім узроўнем ад пацыентаў з нізкім і пацыентаў з высокім узроўнем ад пацыентаў з нізкім.Акрамя таго, значэнні AUC крывой ROC мадэлі прагнастычнага рызыкі складалі 0,905 для прагнозу на 1 год, 0,942 для прагнозу на 2 гады і 0,966 для прагнозу на 3 гады.
Даследчыкі паведамілі, што пацыенты з больш высокай інфільтрацыяй CD8+ Т-клетак былі больш адчувальныя да лячэння ICI [33].Павелічэнне ўтрымання цітотоксіческой клетак, CD56 NK-клетак, NK-клетак і CD8+ Т-клетак у імунным мікраасяроддзі пухліны можа быць адной з прычын опухолесупрессивного эфекту [34].Папярэднія даследаванні паказалі, што больш высокія ўзроўні CD4 (+) T і CD8 (+) T, якія інфільтравалі пухліну, былі значна звязаны з больш працяглай выжывальнасцю [35].Слабая інфільтрацыя Т-лімфацытамі CD8, нізкая нагрузка на неоантиген і моцнае иммунодепрессивное мікраасяроддзе пухліны прыводзяць да адсутнасці адказу на тэрапію ICI [36].Мы выявілі, што паказчык рызыкі адмоўна карэлюе з Т-клеткамі CD8+ і NK-клеткамі, што паказвае на тое, што пацыенты з высокім балам рызыкі могуць быць непрыдатнымі для лячэння ICI і мець горшы прагноз.
CD161 з'яўляецца маркерам натуральных клетак-кілераў (NK).CD8+CD161+ CAR-трансдуцированные Т-клеткі апасродкуюць павышаную супрацьпухлінную эфектыўнасць in vivo ў мадэлях ксенотрансплантата аденокарциномы пратокі падстраўнікавай залозы HER2+ [37].Інгібітары імунных кантрольных кропак нацэлены на шляху цітотоксіческой Т-лімфацыт-асацыяванага бялку 4 (CTLA-4) і бялку запраграмаванай клеткавай гібелі 1 (PD-1)/ліганда запраграмаванай клеткавай гібелі 1 (PD-L1) і маюць вялікі патэнцыял у многіх галінах.Экспрэсія CTLA-4 і CD161 (KLRB1) ніжэй у групах высокай рызыкі, што дадаткова паказвае на тое, што пацыенты з высокім балам рызыкі могуць не мець права на лячэнне ICI.[38]
Каб знайсці варыянты лячэння, прыдатныя для пацыентаў з высокай рызыкай, мы прааналізавалі розныя супрацьпухлінныя прэпараты і выявілі, што паклітаксел, сорафеніб і эрлотиниб, якія шырока выкарыстоўваюцца ў пацыентаў з PAAD, могуць быць прыдатнымі для пацыентаў з высокай рызыкай з PAAD.[33].Zhang et al выявілі, што мутацыі ў любым шляху рэакцыі на пашкоджанне ДНК (DDR) могуць прывесці да дрэннага прагнозу ў пацыентаў з ракам прастаты [39].Даследаванне Pancreatic Cancer Olaparib Ongoing (POLO) паказала, што падтрымлівае лячэнне олапарибом павялічвае выжывальнасць без прагрэсавання ў параўнанні з плацебо пасля першай лініі хіміятэрапіі на аснове плаціны ў пацыентаў з аденокарциномой падстраўнікавай залозы і мутацыямі BRCA1/2 зародкавай лініі [40].Гэта дае значны аптымізм, што вынікі лячэння значна палепшацца ў гэтай падгрупе пацыентаў.У гэтым даследаванні значэнне IC50 AZD.2281 (олапарыб) было вышэй у групе высокай рызыкі, што паказвае на тое, што пацыенты з PAAD у групе высокай рызыкі могуць быць устойлівымі да лячэння AZD.2281.
Мадэлі прагназавання ў гэтым даследаванні даюць добрыя вынікі прагназавання, але яны заснаваныя на аналітычных прагнозах.Як пацвердзіць гэтыя вынікі клінічнымі дадзенымі - важнае пытанне.Эндаскапічная тонкаігольная аспірацыйная ультрагукавая аспірацыя (EUS-FNA) стала незаменным метадам дыягностыкі салідных і экстрапанкреатических паражэнняў падстраўнікавай залозы з адчувальнасцю 85% і спецыфічнасцю 98% [41].З'яўленне іголак для тонкаігольнай біяпсіі EUS (EUS-FNB) у асноўным заснавана на меркаваных перавагах перад FNA, такімі як больш высокая дыягнастычная дакладнасць, атрыманне узораў, якія захоўваюць гісталагічныя структуры, і, такім чынам, стварэнне імуннай тканіны, якая мае вырашальнае значэнне для пэўных дыягназаў.спецыяльная афарбоўка [42].Сістэматычны агляд літаратуры пацвердзіў, што іголкі FNB (асабліва 22G) дэманструюць найбольшую эфектыўнасць пры зборы тканіны з падстраўнікавай залозы [43].Клінічна толькі невялікая колькасць пацыентаў падыходзіць для правядзення радыкальнай аперацыі, і большасць пацыентаў маюць неоперабельные пухліны на момант першаснай дыягностыкі.У клінічнай практыцы толькі невялікая частка пацыентаў падыходзіць для радыкальнай аперацыі, таму што ў большасці пацыентаў на момант першаснай дыягностыкі маюцца неоперабельные пухліны.Пасля паталагічнага пацверджання EUS-FNB і іншымі метадамі звычайна выбіраюць стандартызаванае нехірургічнае лячэнне, такое як хіміятэрапія.Наша наступная даследчая праграма заключаецца ў праверцы прагнастычнай мадэлі гэтага даследавання ў хірургічных і нехірургічных кагортах праз рэтраспектыўны аналіз.
У цэлым наша даследаванне стварыла новую мадэль прагнастычнай рызыкі, заснаваную на парнай irlncRNA, якая паказала шматспадзеўную прагнастычную каштоўнасць у пацыентаў з ракам падстраўнікавай залозы.Наша прагнастычная мадэль рызыкі можа дапамагчы адрозніць пацыентаў з PAAD, якія падыходзяць для медыкаментознага лячэння.
Наборы дадзеных, якія выкарыстоўваюцца і аналізуюцца ў бягучым даследаванні, даступныя ў адпаведнага аўтара па разумным запыце.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Пасрэдніцкая роля самаэфектыўнасці ў эмацыйнай рэгуляцыі негатыўных эмоцый падчас пандэміі COVID-19: крос-секцыйнае даследаванне.Int J Ment Health Nurs [артыкул у часопісе].2021 01.06.2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J і інш.Погляды членаў сям'і на альтэрнатыўныя рашэнні ў аддзяленнях інтэнсіўнай тэрапіі: сістэматычны агляд.INT J NURS STUD [артыкул у часопісе;агляд].2023 01/01/2023; 137:104391.
Вінцэнт А, Герман Дж, Шуліх Р, Хрубан РХ, Гогінс М. Рак падстраўнікавай залозы.Ланцэт.[Артыкул у часопісе;падтрымка даследаванняў, NIH, завочная;падтрымка даследаванняў, урад за межамі ЗША;агляд].2011 г. 13.08.2011; 378 (9791): 607–20.
Іліч М, Іліч І. Эпідэміялогія рака падстраўнікавай залозы.Сусветны часопіс гастраэнтэралогіі.[Артыкул у часопісе, рэцэнзія].2016 г. 28.11.2016; 22 (44): 9694–705.
Лю Х, Чэнь Б, Чэнь Дж, Сун С. Новая tp53-звязаная номограмма для прагназавання агульнай выжывальнасці ў пацыентаў з ракам падстраўнікавай залозы.BMC Cancer [артыкул у часопісе].2021 31-03-2021; 21 (1): 335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Уплыў тэрапіі, арыентаванай на рашэнне, на стомленасць, звязаную з ракам, у пацыентаў з ракам прамой кішкі, якія атрымліваюць хіміятэрапію: рандомізірованное кантраляванае даследаванне.Ракавая медсястра.[Артыкул у часопісе;рандомізірованное кантраляванае даследаванне;даследаванне падтрымліваецца ўрадам за межамі Злучаных Штатаў].2022 05/01/2022; 45 (3): E663–73.
Чжан Чэн, Чжэн Вэнь, Лу І, Шань Л, Сюй Дун, Пан І і інш.Узровень пасляаперацыйнага карциноэмбрионального антыгена (СЕА) прадказвае вынік пасля рэзекцыі колоректального рака ў пацыентаў з нармальным перадаперацыйным узроўнем СЕА.Цэнтр паступальных даследаванняў рака.[Артыкул у часопісе].2020 01.01.2020; 9 (1): 111–8.
Хун Вэнь, Лян Лі, Гу Юй, Ці Цзы, Цю Хуа, Ян Х і інш.Звязаныя з імуннай сістэмай lncRNA генеруюць новыя прыкметы і прадказваюць імунны ландшафт гепатацэлюлярнай карцыномы чалавека.Mol Ther Nucleic acids [Артыкул у часопісе].2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Імунатэрапія рака падстраўнікавай залозы: бар'еры і прарывы.Эн, страўнікава-кішачны хірург [Артыкул у часопісе;агляд].2018 01.07.2018; 2 (4): 274–81.
Халл Р, Мбіта З, Дламіні З. Доўгія некадуючыя РНК (LncRNA), геноміка вірусных пухлін і аберрантныя падзеі сплайсінгу: тэрапеўтычныя наступствы.AM J CANCER RES [артыкул у часопісе;агляд].2021 г. 20.01.2021; 11 (3): 866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Ідэнтыфікацыя сігнатур lncRNA, звязаных з прагнозам рака эндаметрыя.Дасягненні навукі [часопісны артыкул].2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Цзян С, Рэн Х, Лю С, Лу З, Сю А, Цынь С і інш.Комплексны аналіз прагнастычных генаў РНК-звязвае бялку і кандыдатаў у лекі пры нырачна-клеткавай карцыноме сосочка.прадген.[Артыкул у часопісе].2021 г. 2021/01/12:627508.
Лі Х, Чэнь Дж, Юй Цю, Хуан Х, Лю З, Ван Х і інш.Характарыстыкі доўгай некадуючай РНК, звязанай з аутафагіяй, прадказваюць прагноз рака малочнай залозы.прадген.[Артыкул у часопісе].2021 г. 20.01.2021 г. 12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Immune-related six lncRNA signature паляпшае прагноз мультиформной глиобластомы.MOL нейрабіялогія.[Артыкул у часопісе].2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z і інш.Новая сігнатура tri-lncRNA прадказвае выжыванне пацыентаў з ракам падстраўнікавай залозы.ПРАДСТАЎНІКІ ОНКОЛ.[Артыкул у часопісе].2018 12/01/2018; 40 (6): 3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 спрыяе прагрэсаванню рака падстраўнікавай залозы, рэгулюючы экспрэсію LIN28B і шлях PI3K/AKT праз губчатую міР-577.Mol Therapeutics – Нуклеінавыя кіслоты.2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L і інш.Станоўчая зваротная сувязь паміж lncRNA FLVCR1-AS1 і KLF10 можа інгібіраваць прагрэсаванне рака падстраўнікавай залозы па шляху PTEN/AKT.J EXP Clin Cancer Res.2021;40(1).
Чжоу X, Лю X, Цзэн X, Wu D, Лю Л. Ідэнтыфікацыя трынаццаці генаў, якія прадказваюць агульную выжывальнасць пры гепатоцеллюлярную карцынома.Biosci Rep [артыкул у часопісе].2021 09.04.2021.
Час публікацыі: 22 верасня 2023 г